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用DNAMAN軟件,如何導(dǎo)出序列比對(duì)圖

發(fā)布時(shí)間:2023-07-05

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如果核苷酸序列或二級(jí)結(jié)構(gòu)文件不可用怎么辦? 明天給大家介紹一下如何用軟件導(dǎo)入序列對(duì)比圖片。

可用于核苷酸和蛋白質(zhì)的多序列比對(duì),操作方便簡單。

1. 將要比較的序列加載到不同通道中。 方法見右圖(其實(shí)也可以將單個(gè)序列文件逐個(gè)加載到通道中)。 注意:打開文件的格式應(yīng)更改為“”,單擊“否”加載蛋白質(zhì)序列。

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2. 對(duì)導(dǎo)出的序列進(jìn)行多序列比對(duì)。 該技術(shù)如右圖所示。 所有參數(shù)保持默認(rèn),點(diǎn)擊“下一步”。

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對(duì)比后的最終結(jié)果

3. 自定義每個(gè)序列中顯示的“字母”數(shù)量和配色方案。 點(diǎn)擊進(jìn)入調(diào)整面板,然后調(diào)整每行順序顯示的“字母”數(shù)量(右圖藍(lán)色線框),還可以修改字體。 本文保留默認(rèn)值,每行顯示 40 個(gè)多肽殘基。

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4. 下面,根據(jù)序列的相似程度為序列著色。 點(diǎn)擊“色塊”進(jìn)入自定義顏色窗口。 這里你選擇一種越來越亮的顏色。 事實(shí)上,您還可以添加并使用您喜歡的顏色,如右圖所示。

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5.導(dǎo)入圖片

有兩種方式,見右圖dnastar序列比對(duì),但只能導(dǎo)入emf格式的矢量圖形。

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6.關(guān)于emf格式dnastar序列比對(duì),可以直接在Word、PPT中使用。 以下是導(dǎo)入的序列圖片在PPT中的顯示效果(裁剪后):

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