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用Seqman軟件進(jìn)行DNA序列比對(duì)的方法

發(fā)布時(shí)間:2023-08-12

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1、在軟件包中雙擊打開(kāi)。 如何獲取軟件請(qǐng)參見(jiàn)文章末尾。

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2. 點(diǎn)擊“添加”添加待比較的DNA序列。

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3.找到DNA序列所在的文件夾,雙擊需要比對(duì)的序列,然后點(diǎn)擊“完成”

4、然后點(diǎn)擊“”,就會(huì)出現(xiàn)步驟5的界面。

5. 雙擊出現(xiàn)的比較結(jié)果進(jìn)行查看。 如果有多個(gè)結(jié)果,則說(shuō)明所比較的序列有較大差異。

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6. 在此界面中,向左或向右拖動(dòng)頂部滑塊可查看所有比較結(jié)果。 比較結(jié)果中哪里有白色dnastar序列比對(duì),哪里就有差異。

7、選擇測(cè)序公司提供的AB1格式文件的測(cè)序結(jié)果,也可以看到測(cè)序峰。 峰值非常尖銳并且不重疊,表明信號(hào)更可靠。 序列兩端都有白色片段,并且同時(shí)出現(xiàn)重疊峰,這并不意味著序列不正確,但可能是測(cè)序信號(hào)有問(wèn)題。

選擇測(cè)序結(jié)果文件的.Seq格式,只能查看序列,看不到測(cè)序峰。

如今dnastar序列比對(duì),對(duì)于測(cè)序來(lái)說(shuō),通常一個(gè)反應(yīng)可以準(zhǔn)確測(cè)量寬度約為800bp的序列。

因此,如果您的待測(cè)序DNA序列大于800bp,您可以選擇雙向檢測(cè)(正向或反向),

如果小于800且大于1.6k,可以選擇單向測(cè)試,這樣一條DNA序列就會(huì)有正向和反向兩種測(cè)序結(jié)果,

如果小于1.6k,可以選擇測(cè)試通過(guò),公司會(huì)幫你拼接。 拼接結(jié)果就是完整的DNA序列結(jié)果。 比較時(shí),選擇拼接結(jié)果中的即可。

提示:在公眾號(hào)回復(fù)數(shù)字“2”即可獲取.序列比對(duì)軟件包。

封面圖片:,the,1872,莫奈

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