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如何繪制漂亮的多重序列比對(duì)圖

發(fā)布時(shí)間:2023-08-24

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由于軟件功能的限制,一些對(duì)比軟件生成的對(duì)比文件,如*.aln文件,可讀性較差,無法滿足高質(zhì)量出版物的要求。 為此,在實(shí)際操作過程中,需要對(duì)一些多序列比對(duì)文件進(jìn)行著色和美化。

介紹

它是蛋白質(zhì)和DNA序列同源比較的輔助軟件。 它不能手動(dòng)用某種算法對(duì)多個(gè)序列進(jìn)行比較dnastar序列比對(duì),可以對(duì)其他軟件的比較結(jié)果進(jìn)行進(jìn)一步處理。 比如編輯修改,用漂亮的顏色區(qū)分序列之間的同源性,輸出各種漂亮的圖形格式。

下載鏈接:。

使用

1.導(dǎo)出多序列比對(duì)結(jié)果

可以接收多種格式的比較結(jié)果文件,如.fas.msf.aln等格式。 這里以.fas格式(對(duì)比后導(dǎo)入的fasta格式)為例,具體操作如右圖所示:

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導(dǎo)出文件后,點(diǎn)擊完成,導(dǎo)出后的界面如右圖所示:

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2.美化設(shè)置

點(diǎn)擊→,彈出配置界面,可以設(shè)置肽段大小、每行肽段數(shù)、顏色、顯示方式等。

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界面如下:

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點(diǎn)擊→可更改肽序列的順序或更改序列名稱。

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3. 導(dǎo)入

編輯序列后,下一步是導(dǎo)入圖片。 使用 為:單擊“編輯”→“復(fù)制”,選擇要導(dǎo)入的序列。

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然后點(diǎn)擊序列,這樣所有的序列都被選中了dnastar序列比對(duì),整個(gè)背景就會(huì)變成藍(lán)色。

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然后點(diǎn)擊Edit→→導(dǎo)入.rtf文件,并使用word打開該文件。

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導(dǎo)入的文件如下:

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