分子生物學(xué)的必備軟件

分子克隆是生物研究人員不可或缺的實(shí)驗(yàn)技能。 在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中，我們不可避免地要使用一些分子生物學(xué)軟件，例如，NTI...

那么今天我想向大家推薦一款非常好用的質(zhì)粒圖譜設(shè)計(jì)軟件——！

特征：

輕松規(guī)劃和模擬 DNA 操作；

可視化ORF閱讀框和引物結(jié)合位點(diǎn)；

自動(dòng)記錄克隆項(xiàng)目的步驟；

帶注釋的序列文件可以與其他研究人員共享。

用它來(lái)繪制質(zhì)粒圖譜、尋找限制性位點(diǎn)、標(biāo)記基因片段屬性、檢查引物位置、檢查開(kāi)放閱讀框編碼的氨基酸并進(jìn)行序列比較。 它無(wú)疑是分子克隆的有力工具。

界面簡(jiǎn)單

基本功能介紹

序列比對(duì)

序列比對(duì)接口

測(cè)序完成后，我們常常需要進(jìn)行比對(duì)，為后續(xù)實(shí)驗(yàn)做準(zhǔn)備，以保證序列的完整性和準(zhǔn)確性。 序列比對(duì)結(jié)果以簡(jiǎn)單且易于操作的界面呈現(xiàn)。

限制性克隆

限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)

獨(dú)特的受限克隆界面以簡(jiǎn)潔的布局顯示您需要的信息。 如果您已經(jīng)知道自己想做什么，則克隆模擬只需幾秒鐘。 如果克隆程序存在設(shè)計(jì)缺陷，則可以在模擬過(guò)程中捕獲并糾正錯(cuò)誤。

PCR 和誘變

PCR模擬界面

引物設(shè)計(jì)完成后，可用于模擬常規(guī) PCR、重疊延伸 PCR 或誘變。 生成的 DNA 序列文件可立即用于進(jìn)一步操作。 與限制性克隆界面一樣，引物特異性界面以直觀的方式顯示關(guān)鍵信息。

PCR 生成的產(chǎn)物

自動(dòng)記錄

綜合路線歷史圖

最令人驚奇的是，它會(huì)自動(dòng)記錄克隆項(xiàng)目的步驟。 每次編輯序列或模擬克隆、PCR 或誘變時(shí)，程序都會(huì)自動(dòng)記錄在圖形歷史中。 創(chuàng)建模擬 DNA 后dnastar序列比對(duì)，您可以使用歷史記錄作為實(shí)驗(yàn)方案。 最終文件中嵌入了所有原始結(jié)構(gòu)，每個(gè)結(jié)構(gòu)都可以作為單獨(dú)的文件復(fù)活。

瓊脂糖凝膠電泳

瓊脂糖凝膠模擬圖

瓊脂糖凝膠電泳使用先進(jìn)的算法來(lái)創(chuàng)建逼真的瓊脂糖凝膠模擬。 限制性片段以三種格式顯示：模擬凝膠、數(shù)字列表和序列圖。 您可以使用模擬凝膠來(lái)計(jì)劃診斷限制性消化或?qū)?shí)際凝膠圖像與預(yù)測(cè)模式進(jìn)行比較。

DNA 序列注釋非常簡(jiǎn)單，使用

序列特征圖

該格式符合標(biāo)準(zhǔn)，但添加了顏色、方向性和碎片等選項(xiàng)。 編碼序列經(jīng)過(guò)翻譯，以便您可以可視化密碼子、追蹤氨基酸編號(hào)并檢查閱讀框以尋找基因融合。 功能可以從其他文件導(dǎo)入，或從可自定義列表自動(dòng)注釋。

為引物設(shè)計(jì)和可視化提供革命性工具

底漆設(shè)計(jì)圖

使用嚴(yán)格的熱力學(xué)算法來(lái)計(jì)算熔化溫度和雙鏈路徑。 您可以使用引物模擬程序dnastar序列比對(duì)，例如 PCR、誘變和內(nèi)克隆。 引物可以從其他文件導(dǎo)入或?qū)С鰹槲谋靖袷健?/p>

多功能數(shù)據(jù)導(dǎo)入和導(dǎo)出

可以讀取許多常見(jiàn)的文件格式，捕獲 DNA 序列和注釋。 支持的格式列表包括 APE、遺傳工程試劑盒、、 NTI 等。

信息

它不僅可以方便地分析限制位點(diǎn)、標(biāo)簽、啟動(dòng)子、終止子和復(fù)制子元件，并了解它們的具體序列，還可以生成詳細(xì)的DNA序列文件并與同事共享。 視覺(jué)顯示效果和操作效果非常好用。 這是一款不可多得的分子生物學(xué)軟件。 如果你喜歡它，就開(kāi)始吧。

-結(jié)尾-

圖片/來(lái)源文章

編輯/侯亞莉

排版/口航

識(shí)別二維碼

如有侵權(quán)請(qǐng)聯(lián)系刪除！