對于每個進入生物領(lǐng)域的人來說，分子克隆基本上是不可避免的。 當然，還需要一個方便的DNA比對軟件。 今天我向大家強烈推薦一款DNA比對軟件：

猿猴（一）

這個軟件不僅可以做DNA序列比對和DNA序列翻譯dnastar序列比對，還可以做引物設(shè)計、酶切位點設(shè)計、質(zhì)粒圖譜構(gòu)建（這個還是比較有用的，不過是收費的）、ORF搜索等實用功能，下面我就來詳細介紹一下這些常用的功能。

1. DNA序列比對

將序列粘貼到對話框中。 工具欄有一個帶有雙頭箭頭圖標的反向互補工具，可在反向測序期間使用。 創(chuàng)建另一個文件并粘貼所需的序列進行比較：

在“工具”中選擇“對齊兩個”以執(zhí)行雙序列對齊。 結(jié)果一目了然dnastar序列比對，并以紅色清晰標注。 雙擊想要查看的位置即可進入對話框，可以輕松找到突變的位置。

2. 翻譯DNA序列

選擇要翻譯的序列，然后按 ctrl+T 將 DNA 序列翻譯為蛋白質(zhì)序列。 您還可以設(shè)計如何顯示每行的長度和蛋白質(zhì)縮寫。

3. 引物設(shè)計

輸入序列，在Tools中找到find，會彈出一個對話框，包括長度、Tm值、GC含量、GC鉗、二級結(jié)構(gòu)等可以自己設(shè)計的參數(shù)。

4. 酶切位點的設(shè)計

進行分子克隆時，常用的將片段插入質(zhì)粒的方法是限制性酶連接。 這時就需要考慮目標片段適合哪個酶切位點。

輸入序列后，點擊選擇或使用快捷鍵ctrl+E，彈出限制性內(nèi)切酶列表，包括常用的酶。 單擊酶以標記所需的核酸內(nèi)切酶。 雙擊酶名稱，彈出該酶的酶切位點信息。

5.ORF搜索

在序列的任意位置單擊鼠標，然后從該位置開始向后（Find Next）或向前（Find）查找ORF序列。 單擊“查找下一個”，軟件將給出搜索結(jié)果。

APE的Tools還具備很多功能，如質(zhì)粒圖譜構(gòu)建、sgRNA設(shè)計、Gate等強大的設(shè)計功能，滿足了實驗室的大部分常規(guī)使用。 你可以根據(jù)自己的需要來學(xué)習(xí)。

這個軟件對于剛開始學(xué)習(xí)分子克隆的新手來說真的很友好。 快去下載試試吧~

軟件下載鏈接：

如有侵權(quán)請聯(lián)系刪除！