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用DNAMAN軟件,如何導(dǎo)出序列比對(duì)圖

發(fā)布時(shí)間:2023-12-08

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如果核酸序列或二級(jí)結(jié)構(gòu)文件不可用怎么辦? 今天給大家介紹一下如何使用軟件導(dǎo)出序列比對(duì)圖片。

可用于進(jìn)行核酸和蛋白質(zhì)的多重序列比對(duì),操作方便簡(jiǎn)單。

1. 將要比較的序列加載到不同通道中。 方法如下圖所示(當(dāng)然也可以將各個(gè)序列文件逐個(gè)加載到通道中)。 注意:打開(kāi)文件的格式應(yīng)更改為“所有文件”。 單擊“否”加載蛋白質(zhì)序列。

2. 對(duì)導(dǎo)入的序列進(jìn)行多序列比對(duì)。 方法如下圖所示。 所有參數(shù)保持默認(rèn),然后單擊“下一步”。

對(duì)比后的最終結(jié)果

3. 自定義每行順序顯示的“字母”數(shù)量和配色方案。 點(diǎn)擊進(jìn)入調(diào)整面板,在這里可以調(diào)整每行序列中顯示的“字母”數(shù)量(下圖中粉色線框),還可以更改字體。 本文保留默認(rèn)值,每行顯示 40 個(gè)氨基酸殘基。

4. 接下來(lái)dnastar序列比對(duì),根據(jù)序列相似性級(jí)別對(duì)序列進(jìn)行著色。 點(diǎn)擊“色塊”進(jìn)入自定義顏色窗口。 這里選擇了越來(lái)越亮的顏色。 當(dāng)然,您也可以添加并使用您喜歡的顏色,如下所示。

5.導(dǎo)出圖片

有兩種方法dnastar序列比對(duì),見(jiàn)下圖,但只能導(dǎo)出emf格式的矢量圖形。

6.關(guān)于emf格式,可以直接在Word、PPT中使用。 以下是導(dǎo)出的序列圖在PPT中的顯示效果(裁剪后):

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