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MestReNova

發(fā)布時(shí)間:2023-05-20

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mestrenova 14是mestrelab research公司開發(fā)的一款核磁數(shù)據(jù)處理軟件,該軟件主要由NMR、MS、NMRPredict Desktop、DB四部分組成,集NMR和LC/MS數(shù)據(jù)處理分析、預(yù)測(cè)、發(fā)表、驗(yàn)證和及數(shù)據(jù)的儲(chǔ)存、檢索以及管理等功能于一身,支持無(wú)縫共享數(shù)據(jù),可以為用戶提供準(zhǔn)確的數(shù)據(jù)處理。

核磁共振(NMR,Nuclear Magnetic Resonance)是基于原子尺度的量子磁物理性質(zhì)。具有奇數(shù)質(zhì)子或中子的核子,具有內(nèi)在的性質(zhì):核自旋,自旋角動(dòng)量。核自旋產(chǎn)生磁矩。NMR觀測(cè)原子的方法,是將樣品置于外加強(qiáng)大的磁場(chǎng)下,現(xiàn)代的儀器通常采用低溫超導(dǎo)磁鐵。核自旋本身的磁場(chǎng),在外加磁場(chǎng)下重新排列,大多數(shù)核自旋會(huì)處于低能態(tài)。我們額外施加電磁場(chǎng)來(lái)干涉低能態(tài)的核自旋轉(zhuǎn)向高能態(tài),再回到平衡態(tài)便會(huì)釋放出射頻,這就是NMR訊號(hào)。利用這樣的過(guò)程,可以進(jìn)行分子科學(xué)的研究,如分子結(jié)構(gòu)、動(dòng)態(tài)等。

在對(duì)核磁進(jìn)行分析的時(shí)候,小伙伴們一定離不開MestReNova這個(gè)基礎(chǔ)軟件。簡(jiǎn)單的分析想必大家都會(huì),可是如果是要放在文章里的話,可能就需要下一番功夫了。今天小編帶領(lǐng)各位看官一起做一張可以放在文章中的核磁譜圖。(多圖預(yù)警)

第一步:定標(biāo)

要分析核磁圖,首先要先會(huì)打開它(以小編做的一個(gè)材料為例,溶劑為CDCl3)。打開文件夾,選擇任意一個(gè)文件(以acqus為例)后選擇用MestReNova打開。我們最常用的就是下圖中紅色框內(nèi)的幾個(gè)按鈕了。

打開之后的軟件界面如下圖。

首先用下圖中紅框按鈕對(duì)想著重觀察的區(qū)域放大,一般情況下我們首先觀察芳香區(qū),也就是化學(xué)位移在7左右的區(qū)域。

用紅框中的鍵對(duì)溶劑峰定標(biāo)(選擇7.26附近的峰,將ppm值改為7.26)

第二步:標(biāo)峰

選擇圖中紅框圖標(biāo),采用人工標(biāo)峰。框選出你要標(biāo)的峰,然后松手。

峰的化學(xué)位移值如下圖所示。烷基區(qū)同上。

第三步:積分

選擇圖中紅框選中按鈕選擇人工積分。標(biāo)定之后如圖中所示。

第四步:標(biāo)定偶極矩

選擇圖中紅框選中按鈕,選擇“Automatic”。

電腦就會(huì)自動(dòng)對(duì)已經(jīng)已經(jīng)積分的部分進(jìn)行計(jì)算。結(jié)果如下圖所示。

一般來(lái)說(shuō),文章正文中不會(huì)出現(xiàn)核磁譜圖,核磁譜圖通常會(huì)放在supporting information里,文章正文中通常放文字。那么怎么將核磁圖轉(zhuǎn)化為文字呢?不要著急 ,且聽我一一道來(lái)。

點(diǎn)選“Report”,在圖表中就會(huì)出現(xiàn)核磁的文字分析結(jié)果。

選中之后,就可以直接黏貼在你的正文中了(別忘了刪除框框哦)。

第五步:修飾、美化

分析正確之后,如果直接把這樣的譜圖放在文章里,總覺(jué)得和白花花的背景有些維和,為了讓圖譜看的更加和諧,我們就需要對(duì)其進(jìn)行美化。

選擇圖中紅框的“小手”,然后在空白處雙擊左鍵。

選擇右邊第2個(gè)選項(xiàng)卡,按圖中所示,勾選掉3中的兩個(gè)對(duì)鉤,這樣圖譜中背景就會(huì)變成空白。

勾選掉“Vertical”,這樣圖譜中的縱坐標(biāo)就沒(méi)有了。

選擇第3個(gè)選項(xiàng)卡,如圖所示,選擇合適的字體字號(hào)等。

選擇第4個(gè)選項(xiàng)卡,如圖所示,將“Curve”勾選掉,去掉曲線;將2%改為3%,將積分上移。

最后選擇“OK”這樣你就得到了一張漂亮的核磁圖了。

為了使圖形在放大縮小時(shí)不失真,我們需要把圖形保存為矢量圖。

選擇File,save as,將保存類型設(shè)為tiff,保存為矢量圖。

這樣,一張可以放到文章中的標(biāo)準(zhǔn)NMR圖就出爐了!

總結(jié):

總體流程就是:定標(biāo)、標(biāo)峰、積分、標(biāo)定偶極矩、美化。

如果能結(jié)合著Chemdraw,將化學(xué)分子式貼入核磁譜圖中,少年,發(fā)Nature就指日可待了!

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