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用Seqman軟件進(jìn)行DNA序列比對(duì)的方法

發(fā)布時(shí)間:2024-01-19

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1. 雙擊打開(kāi)軟件包。 軟件獲取方法見(jiàn)文末。

dnastar序列比對(duì)_序列比對(duì)工具_(dá)序列比對(duì)的意義

2. 點(diǎn)擊“添加”,添加需要比對(duì)的DNA序列

序列比對(duì)的意義_dnastar序列比對(duì)_序列比對(duì)工具

3.找到DNA序列所在的文件夾,雙擊需要比對(duì)的序列,然后點(diǎn)擊“完成”

4、然后點(diǎn)擊“”,就會(huì)出現(xiàn)步驟5的界面。

5. 雙擊出現(xiàn)的比較結(jié)果進(jìn)行查看。 如果出現(xiàn)多個(gè)結(jié)果,則說(shuō)明所比較的序列有較大差異。

序列比對(duì)工具_(dá)dnastar序列比對(duì)_序列比對(duì)的意義

6. 在此界面中dnastar序列比對(duì),向左或向右拖動(dòng)底部滑塊可查看所有比較結(jié)果。 比較結(jié)果中出現(xiàn)紅色的地方,說(shuō)明存在差異。

7、選擇測(cè)序公司提供的AB1格式文件的測(cè)序結(jié)果dnastar序列比對(duì),也可以看到測(cè)序峰。 峰值很尖銳并且不重疊,表明信號(hào)更可靠。 序列兩端出現(xiàn)紅色片段以及重疊峰的出現(xiàn)并不意味著序列不正確。 可能是測(cè)序信號(hào)的問(wèn)題。

選擇.Seq格式測(cè)序結(jié)果文件僅查看序列而不查看測(cè)序峰。

目前的測(cè)序中,一般一個(gè)反應(yīng)可以準(zhǔn)確測(cè)量長(zhǎng)度約為800bp的序列。

因此,如果您要測(cè)序的DNA序列小于800bp,您可以選擇單向測(cè)試(正向或反向)。

如果數(shù)量大于800且小于1.6k,可以選擇雙向檢測(cè),這樣一條DNA序列就會(huì)有正向和反向兩個(gè)測(cè)序結(jié)果。

如果大于1.6k,可以選擇測(cè)試一下,公司會(huì)幫你拼接。 拼接結(jié)果將是完整的DNA序列結(jié)果。 比較時(shí),選擇拼接結(jié)果中的即可。

提示:在公眾號(hào)回復(fù)數(shù)字“2”即可獲取.0綠色序列比對(duì)軟件包。

封面圖片:《1872》,莫奈

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