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SnapGene分子生物學(xué)必備軟件

發(fā)布時間:2023-07-23

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分子生物學(xué)的必備軟件

分子克隆對于生物研究者來說是一項(xiàng)必備的實(shí)驗(yàn)技能,在實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中我們無法避免使用一些分子生物學(xué)軟件,比如,,NTI……

那么明天我就給大家推薦一款特別好用的引圖設(shè)計(jì)軟件——!

特征:

輕松規(guī)劃和模擬 DNA 操作;

可視化 ORF 閱讀框和質(zhì)粒結(jié)合位點(diǎn);

手動記錄克隆項(xiàng)目的步驟;

指定的序列文件可以與其他研究人員共享。

用它作為引物圖譜,查找限制性位點(diǎn),標(biāo)記基因片段特性,查看質(zhì)粒位置,查看開放閱讀框編碼的多肽,并進(jìn)行序列比對。 這無疑是分子克隆的產(chǎn)物。

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簡單的界面

基本功能介紹

序列比對

序列比對接口

測序完成后dnastar序列比對,我們常常需要對后續(xù)的實(shí)驗(yàn)進(jìn)行比對和規(guī)劃,以保證序列的完整性和準(zhǔn)確性。 在易于操作的界面中突出顯示序列比對結(jié)果。

限制性克隆

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限制性內(nèi)切酶位點(diǎn)

獨(dú)特的有限克隆界面以簡潔的布局顯示您需要的信息。 如果您已經(jīng)知道自己想做什么,克隆模擬只需要幾秒鐘。 如果克隆程序存在設(shè)計(jì)缺陷,可以在模擬過程中發(fā)現(xiàn)并糾正錯誤。

PCR 和誘變

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PCR模擬界面

質(zhì)粒設(shè)計(jì)完成后,可用于模擬傳統(tǒng) PCR、重疊延伸 PCR 或誘變。 生成的 DNA 序列文件可立即用于進(jìn)一步操作。 與限制性克隆篩選一樣,質(zhì)粒特異性篩選以直觀的方式呈現(xiàn)關(guān)鍵信息。

PCR產(chǎn)物

手冊文檔

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合成途徑歷史圖

最令人驚奇的是,它手動記錄了克隆項(xiàng)目的步驟。 每次編輯序列或模擬克隆或 PCR 或誘變時,該過程都會手動記錄在圖形歷史中。 創(chuàng)建模擬 DNA 后,您可以使用歷史記錄作為實(shí)驗(yàn)方案。 最終文件中嵌入了所有原始結(jié)構(gòu),每個結(jié)構(gòu)都可以作為單獨(dú)的文件重新啟動。

瓊脂糖凝膠電泳

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瓊脂糖凝膠模型

瓊脂糖凝膠電泳使用先進(jìn)的算法來創(chuàng)建逼真的瓊脂糖凝膠模擬。 限制性片段以三種格式顯示:模擬凝膠、數(shù)字列表和序列圖。 您可以使用模擬凝膠計(jì)劃明確的限制性消化,或?qū)?shí)際凝膠圖像與預(yù)測模式進(jìn)行比較。

使用dnastar序列比對,DNA序列注釋非常簡單

序列特征圖

該格式符合標(biāo)準(zhǔn),但添加了顏色、方向性和碎片等選項(xiàng)。 編碼序列經(jīng)過翻譯,因此您可以可視化密碼子、跟蹤肽編號并檢測基因融合的閱讀框。 可以從其他文件導(dǎo)出功能,或從可自定義列表手動注釋。

為質(zhì)粒設(shè)計(jì)和可視化提供革命性工具

質(zhì)粒藍(lán)圖

使用嚴(yán)格的熱力學(xué)算法來估計(jì)熔化溫度和雙鏈線。 您可以使用質(zhì)粒模擬程序,例如 PCR、誘變和內(nèi)克隆。 質(zhì)??梢詮钠渌募?dǎo)出或?qū)霝槲谋靖袷健?/p>

多功能數(shù)據(jù)導(dǎo)出和導(dǎo)入

可以讀取許多常見的文件格式,捕獲 DNA 序列和注釋。 支持的格式列表包括 APE、APE、遺傳工程試劑盒、、 NTI 等。

信息

它不僅可以方便地分析限制位點(diǎn)、標(biāo)簽、啟動子、終止子和復(fù)制子成分,并了解它們的具體序列,還可以生成詳細(xì)的DNA序列文件與同學(xué)分享。 直觀地展示療效和操作療效,非常好用,這是一款不可多得的分子生物學(xué)軟件,如果您喜歡,請拔草。

-結(jié)尾-

圖片/來源文章

編輯/侯亞莉

排版/寇航

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