自1985年日本PE-Cetus公司人類遺傳學實驗室發(fā)明劃時代的聚合酶鏈式反應（PCR）以來，PCR技術具有特異性、靈敏、高產(chǎn)、快速、簡單、重復性好等優(yōu)點。 很快它就被廣泛使用。 PCR已成為分子生物學領域最基本、最重要的技術手段之一。 質(zhì)粒設計是PCR技術的重要組成部分。 找到一對合適的核酸片段作為質(zhì)粒，從模板DNA序列中有效擴增目標片段。

質(zhì)粒設計過程

質(zhì)粒設計應遵循三個基本原則：

①引物和模板的序列應緊密互補；

②防止引物與質(zhì)粒之間形成穩(wěn)定的二聚體或頭飾結(jié)構(gòu)；

③引物不能在模板的非目標位點引起DNA聚合反應（即錯配）。

到目前為止dnastar引物設計dnastar引物設計，最常用的質(zhì)粒設計軟件是6.25和在線工具3，質(zhì)粒評估軟件是。

6.25

-BLAST（用于PCR質(zhì)粒的設計和測量）

3（全面的PCR質(zhì)粒和雜交探針設計工具；許多選項首選默認值。）

（同源——簡并雜合寡核苷酸質(zhì)粒設計；簡并PCR質(zhì)粒設計；接受未比對的序列。）

?bryan/irc/-/-cache/.html

Gene（用于標準和簡并質(zhì)粒的交互式質(zhì)粒設計工具；接受未比對的序列。）

;=

與Pro

PCR（用于序列突變的限制性分析）

.4（通過增加隨機質(zhì)粒形成的概率來增加 PCR 噪音。）

.4（基于蛋白質(zhì)和核苷酸或單肽鏈多重比對的PCR質(zhì)粒設計工具。）

（質(zhì)粒設計工具，首次使用需注冊）

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