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那令人困惑的比對工具選擇啊~

那時候使用的比對工具是。官方稱其可以把短的DNA序列(35bp)快速的比對到人類基因組上。結(jié)論:和,是兩個不同類型的比對工具,并非是的升級。/工具本身不能進(jìn)行比對,它是通過調(diào)用/進(jìn)行比對的??赡苁且驗?..

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(偽)從零開始學(xué)轉(zhuǎn)錄組(5) 序列比對

順便對bam文件進(jìn)行簡單QC,參考直播我的基因組系列。為了提高比對速度,就需要根據(jù)參考基因組序列,經(jīng)過BWT算法轉(zhuǎn)換成index,而我們比對的序列其實是index的一個子集。當(dāng)然轉(zhuǎn)錄組比對還要考慮到可...

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(偽)從零開始學(xué)轉(zhuǎn)錄組(5) 序列比對

順便對bam文件進(jìn)行簡單QC,參考直播我的基因組系列。為了提高比對速度,就需要根據(jù)參考基因組序列,經(jīng)過BWT算法轉(zhuǎn)換成index,而我們比對的序列其實是index的一個子集。當(dāng)然轉(zhuǎn)錄組比對還要考慮到可...

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