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發(fā)布時(shí)間:2023-06-30
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您好,博鰲經(jīng)典草藥計(jì)量技術(shù)知識(shí)分享系列明天開始,明天給大家分享第一部分理論部分:
實(shí)驗(yàn)方法原理
PCR技術(shù)的基本原理與DNA的自然復(fù)制過程類似,其特異性取決于與目標(biāo)序列兩端互補(bǔ)的寡核苷酸質(zhì)粒。
PCR由三個(gè)基本反應(yīng)步驟組成:變性-固溶-延伸:
①模板DNA的變性:將模板DNA加熱至94℃左右一定時(shí)間后,模板的雙鏈DNA或PCR擴(kuò)增產(chǎn)生的雙鏈DNA解離,成為單鏈,便于與質(zhì)粒結(jié)合。 回合反應(yīng)計(jì)劃;
②模板DNA與質(zhì)粒固溶(復(fù)性):模板DNA加熱變性成單鏈后,溫度降至55℃左右,質(zhì)粒與模板DNA單鏈的互補(bǔ)序列配對(duì);
③引物延伸:DNA模板-質(zhì)粒結(jié)合物在Taq酶的作用下,以dNTP為反應(yīng)原料,以目的序列為模板,根據(jù)核苷酸配對(duì)和半保守原理合成新的互補(bǔ)模板DNA鏈復(fù)制 半保守復(fù)制鏈。
通過重復(fù)循環(huán)變性-溶液-延伸三個(gè)過程,可以獲得更多的“半保留復(fù)制鏈”,但這些新的鏈可以成為上一個(gè)循環(huán)的模板。 完成一個(gè)循環(huán)需要2到4分鐘,要擴(kuò)增數(shù)百萬倍的基因需要2到3小時(shí)。
實(shí)驗(yàn)材料
1. 試劑和試劑盒
2、儀器及耗材
模板DNA
PCR儀
脫氧核糖核酸
移液槍
聚合酶
PCR板
蒸餾水
薄壁管
PCR緩沖液
離心管
質(zhì)粒
離心管盒
溴化鎂
實(shí)驗(yàn)流程
1. 標(biāo)準(zhǔn)PCR反應(yīng)體系
10X 放大緩沖液
10ul
4 dNTP 混合物
個(gè)/升
質(zhì)粒
每次10~
模板DNA
0.1~2ug
聚合酶
2.5u
鎂2+
1.5毫摩爾/升
加入雙蒸水或三蒸水
100ul
2. PCR 質(zhì)粒設(shè)計(jì)
PCR反應(yīng)中有兩個(gè)質(zhì)粒,5'末端質(zhì)粒和3'引物。 設(shè)計(jì)質(zhì)粒時(shí),以DNA單鏈為基準(zhǔn)(通常基于信息鏈),5'端質(zhì)粒與位于待擴(kuò)增片段5'端的一小段DNA序列相同; 3' 端的一小段 DNA 序列是互補(bǔ)的。
1. 質(zhì)粒設(shè)計(jì)的基本原理
(1)質(zhì)粒寬度:15-30bp,通常在20bp左右。
(2)質(zhì)粒核苷酸:G+C濃度優(yōu)選為40-60%。 如果G+C太少,擴(kuò)增效果不好,如果G+C太多,則容易出現(xiàn)非特異性條帶。 ATGC 最好隨機(jī)分布dnastar引物設(shè)計(jì),以防止超過 5 個(gè)甾醇或吡啶堿基的簇。
(3) 質(zhì)粒內(nèi)部不應(yīng)出現(xiàn)互補(bǔ)序列。
(4)兩個(gè)質(zhì)粒之間不應(yīng)有互補(bǔ)序列,特別是要防止3'端互補(bǔ)重疊。
(5) 質(zhì)粒與非特異性擴(kuò)增區(qū)域序列的同源性不應(yīng)超過70%,且質(zhì)粒3'端的8個(gè)連續(xù)核苷酸在待擴(kuò)增區(qū)域之外不應(yīng)有完整的互補(bǔ)序列,否則容易造成非特異性擴(kuò)增。
(6) 質(zhì)粒3'端的核苷酸,特別是最后一個(gè)和倒數(shù)第二個(gè)核苷酸,應(yīng)嚴(yán)格配對(duì),最好的選擇是G和C。
(7) 質(zhì)粒的5'端可以進(jìn)行修飾。 如添加限制性酶切位點(diǎn)、引入突變位點(diǎn)、使用生物素、熒光物質(zhì)、地高辛標(biāo)記、添加其他短序列dnastar引物設(shè)計(jì),包括起始密碼子、終止密碼子等。
2. 質(zhì)粒設(shè)計(jì)軟件
.0(手動(dòng)搜索)*,(質(zhì)粒評(píng)估),,,Omiga,,(在線服務(wù))。
3. 模板準(zhǔn)備
4. PCR反應(yīng)條件的控制
5. PCR循環(huán)參數(shù)
6. PCR 步驟
看到第二步實(shí)驗(yàn)就已經(jīng)很頭疼了,小編已經(jīng)省略了第三、四、五、六步的介紹了。
您只需要了解PCR原理,剩下的就由博鰲經(jīng)典中藥檢查PCR試劑盒來完成。 無需復(fù)雜的試劑配制、引物設(shè)計(jì)等; 只需要區(qū)分套件A和套件B即可。
本知識(shí)分類系列的發(fā)布,就是為了與廣大藥檢朋友交流、交流、進(jìn)步。 歡迎您留言交流。
我們工作中面臨的草藥來源包括:根、莖、葉; 干產(chǎn)品和濕產(chǎn)品; 次生代謝產(chǎn)物很多,如何有效提取不同中藥材的DNA模板,請(qǐng)關(guān)注之前的通知《中藥材DNA提取及注意事項(xiàng)》。
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