?引物、探針、Real-time PCR 的探針設(shè)計(jì)原則。

一般定量PCR實(shí)驗(yàn)過程為：目的基因查找比對(duì)→探針與引物設(shè)計(jì)→探針與引物合成→配置反應(yīng)體系→反應(yīng)參數(shù)→重復(fù)實(shí)驗(yàn)，優(yōu)化條件→獲得曲線數(shù)據(jù)，比對(duì)標(biāo)準(zhǔn)曲線→再重復(fù)驗(yàn)證。引物設(shè)計(jì)原則探針設(shè)計(jì)原則探針設(shè)計(jì)

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那令人困惑的比對(duì)工具選擇啊~

那時(shí)候使用的比對(duì)工具是。官方稱其可以把短的DNA序列（35bp）快速的比對(duì)到人類基因組上。結(jié)論：和，是兩個(gè)不同類型的比對(duì)工具，并非是的升級(jí)。/工具本身不能進(jìn)行比對(duì)，它是通過調(diào)用/進(jìn)行比對(duì)的?？赡苁且?yàn)?..

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新型冠狀病毒熒光PCR引物探針設(shè)計(jì)，難在哪里？

在新型冠狀病毒檢測(cè)中，以美國CDC的第一套引物探針為例，從圖1可見，上游引物處SARS病毒有一個(gè)3-bp的插入，是不可能擴(kuò)增的，蝙蝠病毒在上游引物有4個(gè)突變，探針有1個(gè)突變，下游引物有5個(gè)突變，理論上...

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hisat2:比對(duì)基因組工具簡(jiǎn)介

由于測(cè)序儀機(jī)器讀長(zhǎng)的限制，在構(gòu)建文庫的過程中首先需要將DNA片段化，測(cè)序得到的序列只是基因組上的部分序列。為了確定測(cè)序reads在基因組上的位置，需要將reads比對(duì)回參考基因組上，這個(gè)步驟叫做。同時(shí)...

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如何進(jìn)行基因組序列比對(duì)？

首先要做的就是將測(cè)序得到的reads比對(duì)到人基因組參考序列上。人基因組參考序列的來源、詳細(xì)信息及下載地址已經(jīng)知道啦，那么我們來看看利用什么軟件或算法來將測(cè)序數(shù)據(jù)比對(duì)到31億堿基序列上呢？大家是否對(duì)于比...

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干貨：m6A RNA甲基化MeRIP-seq測(cè)序分析實(shí)驗(yàn)全流程解析

本期，我們講講甲基化RNA免疫共沉淀(MeRIP-seq/m6A-seq)實(shí)驗(yàn)怎么做，從技術(shù)原理、建庫測(cè)序流程、信息分析流程和研究套路等四方面詳細(xì)介紹。對(duì)沉淀下來的RNA片段進(jìn)行高通量測(cè)序，結(jié)合生物信...

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