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熒光定量PCR相關(guān)設(shè)計(jì)

一:引物設(shè)計(jì)原則(1)引物長(zhǎng)度17~25bp,擴(kuò)增序列長(zhǎng)度90~150個(gè)堿基,GC含量40~60%。(7)引物設(shè)計(jì)完成后使用-BLAST檢索確認(rèn)引物的特異性。(2)要確保探針的Tm值比引物的高5-10...

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科研干貨丨網(wǎng)絡(luò)免費(fèi) 在線引物設(shè)計(jì)工具已送達(dá)

引物設(shè)計(jì)是PCR技術(shù)中至關(guān)重要的一環(huán),尋找一對(duì)合適的核苷酸片段作為引物,使其有效地從模板DNA序列擴(kuò)增目的片段。引物設(shè)計(jì)時(shí)要遵循三條基本原則:③引物不能在模板的非目的位點(diǎn)引發(fā)DNA聚合反應(yīng)(即錯(cuò)配)。...

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極客學(xué)院|分子診斷技術(shù)——突變阻滯擴(kuò)增系統(tǒng)

在基因檢測(cè)中,利用ARMS原理可實(shí)現(xiàn)靶序列擴(kuò)增的同時(shí)避免非目的片段的擴(kuò)增。為提高引物特異性,可在3′端倒數(shù)第2位或第3位堿基處額外引入一個(gè)錯(cuò)配堿基,使引物可正常擴(kuò)增靶序列,而非目的片段不擴(kuò)增。在產(chǎn)品設(shè)...

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研發(fā): 定量PCR Taqman探針設(shè)計(jì)寶典!

實(shí)驗(yàn)過程為:目的基因查找比對(duì)→探針與引物設(shè)計(jì)→探針與引物合成→配置反應(yīng)體系→反應(yīng)參數(shù)→重復(fù)實(shí)驗(yàn),優(yōu)化條件→獲得曲線數(shù)據(jù),比對(duì)標(biāo)準(zhǔn)曲線→再重復(fù)驗(yàn)證。引物設(shè)計(jì)原則:探針設(shè)計(jì):另外循環(huán)參數(shù)雖然在引物和探針設(shè)...

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實(shí)時(shí)熒光 Taqman 探針設(shè)計(jì)、選擇、引物設(shè)計(jì)及評(píng)價(jià)。

端也能檢測(cè)到熒光信號(hào),但卻是在3’端),可在互補(bǔ)的序列中設(shè)計(jì)引物與探針。先對(duì)各個(gè)亞群設(shè)計(jì)各自保守的引物與探針,然后探針用同一染料標(biāo)記,這樣在實(shí)時(shí)PCR反應(yīng)中,雖然是多重PCR反應(yīng),但報(bào)告卻是同一個(gè)染料...

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熒光定量PCR相關(guān)設(shè)計(jì)

一:引物設(shè)計(jì)原則(1)引物長(zhǎng)度17~25bp,擴(kuò)增序列長(zhǎng)度90~150個(gè)堿基,GC含量40~60%。(2)要確保探針的Tm值比引物的高5-10℃,在退火過程中優(yōu)先結(jié)合到模板上。三:引物探針設(shè)計(jì)工具原則...

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這兩個(gè)引物設(shè)計(jì)網(wǎng)站,最適合萌新入手!

今天給大家介紹一種適合新手的引物設(shè)計(jì)方法,非常適合剛?cè)腴T的新手使用。如何查看引物設(shè)計(jì)結(jié)果?以上就是利用和兩個(gè)網(wǎng)站進(jìn)行引物設(shè)計(jì)的步驟,是不是很簡(jiǎn)單呢?

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?引物、探針、Real-time PCR 的探針設(shè)計(jì)原則。

一般定量PCR實(shí)驗(yàn)過程為:目的基因查找比對(duì)→探針與引物設(shè)計(jì)→探針與引物合成→配置反應(yīng)體系→反應(yīng)參數(shù)→重復(fù)實(shí)驗(yàn),優(yōu)化條件→獲得曲線數(shù)據(jù),比對(duì)標(biāo)準(zhǔn)曲線→再重復(fù)驗(yàn)證。引物設(shè)計(jì)原則探針設(shè)計(jì)原則探針設(shè)計(jì)

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PCR技術(shù)原理及中藥檢測(cè)應(yīng)用

模板DNA的變性:模板DNA經(jīng)加熱至94℃左右一定時(shí)間后,使模板DNA雙鏈或經(jīng)PCR擴(kuò)增形成的雙鏈DNA解離,使之成為單鏈,以便它與引物結(jié)合,為下輪反應(yīng)做準(zhǔn)備;引物設(shè)計(jì)的基本原則引物設(shè)計(jì)軟件無需繁瑣的...

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核酸序列分析工具

多序列比對(duì)分析軟件目前有很多功能強(qiáng)大的生物學(xué)軟件,具有豐富功能引物設(shè)計(jì),基因序列比對(duì),質(zhì)粒圖譜繪制、甚至實(shí)現(xiàn)了1個(gè)軟件同時(shí)對(duì)DNA、RNA和蛋白質(zhì)進(jìn)行分析的功能。(1)是一款高度集成化的分子生物學(xué)應(yīng)用...

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新型冠狀病毒熒光PCR引物探針設(shè)計(jì),難在哪里?

在新型冠狀病毒檢測(cè)中,以美國(guó)CDC的第一套引物探針為例,從圖1可見,上游引物處SARS病毒有一個(gè)3-bp的插入,是不可能擴(kuò)增的,蝙蝠病毒在上游引物有4個(gè)突變,探針有1個(gè)突變,下游引物有5個(gè)突變,理論上...

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普通實(shí)時(shí)熒光定量聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(qRT

在進(jìn)行PCR反應(yīng)時(shí),寡核苷酸引物(rs)是必要的。俗話說技多不壓身,這個(gè)理念對(duì)于設(shè)計(jì)引物也是一個(gè)樣,極少數(shù)情況下NCBI設(shè)計(jì)的引物在實(shí)驗(yàn)中可能不可用,例如溶解曲線不是標(biāo)準(zhǔn)的峰(非單峰)、無法靶向基因,...

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